Не все данные приходят из БД

При попытке достать данные из БД с 5ю связными таблицами приходит только 2. Поиск осуществляется по id array элементов. Почему так происходит и как это можно решить? Сразу скажу, что достаю 700+ записей

Попробовал изменить количество в блоке with и вижу, что проблема пока только с 2 таблицами.
UPDATE. Если тянуть из БД количество намного меньшее, то все работает корректно.

Без каких-то дополнительных деталей трудно сказать что-то конкретное.
Но самый лучший способ проверки тут - самостоятельный вызов полученного SQL запроса.
В логах можно найти, какой точно SQL запрос формируется, если выполнить его вручную, то возможно, будут видны какие-то ошибки, станет понятно куда копать.

@Basil_K спасибо за помощь! Проблема оказалась в другом, а это лишь следствие.

@Alexandr_Yaskunov Здравствуйте, подскажите в чем была проблема?

@leryq_it здравствуйте! По какой-то причине при обработке 700+ строк 2 поля были затерты. При повторном действии уже на следующий день все было хорошо. Вчера тестировал этот процесс - все ок. Проблемный БП я пофиксил, думаю, что такого больше не будет.